Junto com mais de 40 pós-graduações da UFRJ, O PPGE-UFRJ integra o Programa Institucional de Internacionalização, o qual é fomentado pela CAPES (PrInt/UFRJ). O tema do PrInt UFRJ é Sustentabilidade, e o PPGE-UFRJ atua no eixo Sustentabilidade e Proteção à Vida. Até o momento, três discentes de doutorado sandwich já fizeram os seus estágios no exterior, via Projeto PrInt, em Universidades da Austrália, Reino Unido e Suíça.
O PPGE-UFRJ tem recebido discentes de outros países (Colômbia, Bolívia, Portugal, Suécia e França) para fazer pós-graduação, com ênfase no doutorado. O mesmo ocorre em relação aos pós-docs PNPDs, cujos países de origem incluem Portugal e Espanha.
Nos últimos anos, o PPGE-UFRJ teve cinco Projetos Pesquisador Visitante Estrangeiro (PVE), cujas parcerias envolveram as seguintes instituições no exterior: Zoological Society of London (Reino Unido), Czech Academy of Sciences (República Tcheca), Estación Experimental de Zonas Áridas, Almeria (Espanha), University of York (Reino Unido) e University of British Columbia (Canadá).
Docentes do PPGE-UFRJ também tem estado envolvidos nos seguintes projetos e iniciativas de âmbito internacional: 1) LINCGlobal (CSIC, Espanha, PUC-Chile, Chile), o qual é uma parceria internacional entre a Universidade Federal do Rio de Janeiro, o Consejo Superior de Investigaciones Cientificas (Espanha) e a Pontificea Universidad Católica de Chile (Chile), com objetivo de alavancar estudos em parcerias, realizar cursos e elaborar produtos e atividades de extensão sobre as mudanças globais (perda de biodiversidade, mudanças climáticas, poluição, etc) e seus efeitos na IberoAmérica; 2) Painel Intergovernamental de Mudanças Climáticas (IPCC) da ONU; 3) Projeto RESILIENSE (Centre Nacional de la Researche Scientifique CNRS, França, financiado pela ANR) e 3) Synthesis and Analysis of Biodiversity (CESAB, França). O objetivo principal desses últimos projetos é avaliar padrões e mecanismos relacionados à resistência de ecossistemas em função de mudanças no clima.
A internacionalização do PPGE-UFRJ tem, também, grande representatividade na área de sustentabilidade e ecologia da restauração, onde temos a atuação de docentes que são membros do Instituto Internacional para a Sustentabilidade (IIS/RJ).